Caractéristiques territoriales associées aux prévalences d'Escherichia Coli producteur de beta-lactamase à spectre étendu dans les infections urinaires communautaires - INRAE - Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement
Theses Year : 2020

Local characteristics associated with the prevalences of Escherichia Coli producing extended spectrum beta-lactamase in community-acquired urinary tract infections

Caractéristiques territoriales associées aux prévalences d'Escherichia Coli producteur de beta-lactamase à spectre étendu dans les infections urinaires communautaires

Abstract

The aim of this study was to determine whether ESBL-E. coli rate in urine samples from individuals with community-acquired UTIs was associated with the local socio-economic, environmental, agricultural and healthcare characteristics. Methods: Cross-sectional study in western France using data on antibiotic susceptibility of E. coli isolated from urine samples of individuals with community-acquired UTI analysed in non-hospital laboratories from 2015 to 2017. ESBL-E. coli rate was calculated for each laboratory. Data on socio-economic characteristics, human antibiotic consumption, hospital bed density, animal farming density, and percentage of agricultural land and surface water were retrieved at the commune level and aggregated by study area. Their association with ESBL-E. coli prevalence was quantified using multivariate linear regression models with a backward selection. Results: From 358,291 E. coli isolates from urine samples tested in 92 laboratories, the mean ESBL-E. coli prevalence was 3.30%. In adjusted model, ESBL-E. coli rate was significantly (p<0.05) associated with the local percentage of >65-year-old people, 3rd generation cephalosporin in use (DDD/1000 inhabitants), number of hospital beds per km², poultry density, pig density, and percentage of agricultural land
L'objectif de cette étude était de déterminer si les taux d’E. coli BLSE dans les échantillons d'urine de patients non hospitalisés, étaient associés aux caractéristiques socio-économiques, environnemen-tales, agricoles et sanitaires du territoire de vie de ces individus. Méthodes : Étude transversale, menée dans l'ouest de la France, utilisant des données de la sensibilité aux antibiotiques d'E. coli isolé dans des échantillons d'urine, analysés dans des laboratoires non hospitaliers de 2015 à 2017. Le taux d'E. coli BLSE a été calculé pour chaque laboratoire. L’impact des caractéristiques territoriales (socio-économiques, agro-environnemen-tales, liées aux soins) sur la prévalence d'E. coli BLSE dans les urines a été quantifié à l'aide de modèles de régression linéaire multivariée. Résultats : Sur 358 291 isolats d'E. coli provenant d'échantillons d'urine testés dans 92 laboratoires, la prévalence d'E. coli BLSE était de 3,30 %. Le taux d'E. coli BLSE était significativement (p<0,05) associé au pourcentage de personnes âgées de plus de 65 ans, à l'utilisation de céphalosporine de 3ieme génération (DDJ/1000 hab), à la densité de lits d'hôpitaux, à la densité de volailles et de porcs et au pourcentage de terres agricoles
No file

Dates and versions

tel-04557755 , version 1 (24-04-2024)

Identifiers

  • HAL Id : tel-04557755 , version 1

Cite

Stéphanie Larramendy. Caractéristiques territoriales associées aux prévalences d'Escherichia Coli producteur de beta-lactamase à spectre étendu dans les infections urinaires communautaires. Sciences du Vivant [q-bio]. Université de Nantes (UN), 2020. Français. ⟨NNT : ⟩. ⟨tel-04557755⟩

Collections

INRAE
9 View
0 Download

Share

More