Compte-rendu scientifique final du projet pre-maturation INRA 2018-2020 PROVIDEFENSE Titre du projet : Production de défensines aviaires recombinantes pour la santé animale - INRAE - Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement Accéder directement au contenu
Rapport Année : 2020

Final scientific report of the INRA pre-maturation project 2018-2020 PROVIDEFENSE Title of the project : Production of recombinant avian defensins for animal health

Compte-rendu scientifique final du projet pre-maturation INRA 2018-2020 PROVIDEFENSE Titre du projet : Production de défensines aviaires recombinantes pour la santé animale

Résumé

Defensins are natural antimicrobial peptides in the innate immunity of animals. Two avian defensins, AvBD2 and AvBD7, extracted and purified from chicken bone marrow, are active against Gram and Gram+ pathogenic bacteria and are remarkably resistant to proteolysis. Importantly, the antimicrobial efficacy of AvBD7 was recently demonstrated in a mouse model of systemic salmonellosis. These specific properties make AvBD2 and AvBD7 promising therapeutic candidates as alternatives to antibiotics. In addition, large-scale production of these molecules is necessary for their industrial development. The project therefore aimed to demonstrate proof of concept for the recombinant production of highly antimicrobial AvBD2 and AvBD7. The first objective was to develop an expression system (i) in the yeast Yarrowia lipolytica, which benefits from high-performance tools (inducible promoters, new secretion sequences) for the production of heterologous proteins, and (ii) in the insect S2 cell, which has been proven to produce molecules structurally very similar to defensins. The second objective was to define and express AvBD2 and AvBD7 variants substituted on certain selected amino acids to increase the antibacterial activity of the molecules against a panel of pathogenic bacterial strains, comparing this activity with that of natural molecules. The third objective was to scale up production of the most active variants and to provide protocols for the production and purification of transferable defensins. The spin-offs in terms of alternative therapeutic applications to antibiotics are attractive, particularly for the pharmaceutical industry, with significant demand in public and veterinary health. This project, with its high potential for commercialization, was set up with the intention of protecting the AvBD2 and AvBD7 variants obtained by filing a patent application. An important positive point achieved with this project is the construction of the AvBD7 gene in Yarrowia lipolytica including the complete native pre-pro-Lip2 (SSLP) addressing sequence, which enables defensin to be produced more efficiently. In addition, a method developed by partner 1 was used to assess the quantity produced. This quantity was improved by partner 2 through the overexpression of a Yarrowia chaperone protein (PDI), through the composition of its culture medium, and through the fermentation and promoter induction conditions during the feedbatch. However, the synthetic medium of the subsequent industrial culture made it difficult to quantify defensin production by ELISA. These results underline the difficulty of obtaining these molecules at concentrations that allow measurement of biological activity. They also show that we succeeded in: (i) get Yarrowia lipolytica to produce each defensin by optimising the promoter and signal sequence of the gene construct, which had never been done before; (ii) increase the production level tenfold by adding the Yl chaperone protein and increasing the scale of production; (iii) identify amino acids potentially targeted by mutations aimed at increasing antimicrobial activity. Finally, even if the two avian defensins could be produced in fermenters at non-exploitable concentrations (around 3mg/L), it is highly probable that their production in the natural host by heterophilic cells must take place under conditions that are particularly difficult to transpose to a yeast system and on an industrial scale. However, it is conceivable that the production of these antimicrobial molecules could be amplified in vivo to act as a barrier to infection by stimulating the host animal through food or vaccination.
Les défensines sont des peptides antimicrobiens naturels de l'immunité innée des animaux. Deux défensines aviaires nommées AvBD2 et AvBD7, extraites et purifiées à partir de la moelle osseuse du poulet, sont actives contre des bactéries pathogènes Gram-et Gram+ et sont remarquablement résistantes à la protéolyse. De manière importante, l'efficacité antimicrobienne de l'AvBD7 a été récemment démontrée dans un modèle murin de salmonellose systémique. Ces propriétés particulières font de l'AvBD2 et de l'AvBD7 des candidats thérapeutiques prometteurs en alternative aux antibiotiques. Par ailleurs, la production de ces molécules à grande échelle est nécessaire à leur développement industriel. Le projet visait donc à faire la preuve de concept de production recombinante d'AvBD2 et d'AvBD7 fortement antimicrobiennes. L'objectif premier était de développer un système d'expression (i) chez la levure Yarrowia lipolytica qui bénéficie d'outils performants (promoteurs inductibles, nouvelles séquences de sécrétion) pour la production de protéines hétérologues et (ii) chez la cellule S2 d'insecte qui a fait ses preuves pour produire des molécules structuralement très proches des défensines. Le second objectif était de définir et exprimer des variants d'AvBD2 et d'AvBD7 substitués sur certains acides aminés choisis pour augmenter l'activité antibactérienne des molécules vis-à-vis d'un panel de souches bactériennes pathogènes en comparant cette activité à celle des molécules naturelles. Le troisième objectif était de monter en échelle de production des variants les plus actifs et de fournir des protocoles de production et de purification des défensines transférables. Les retombées en termes d'application thérapeutique alternative aux antibiotiques sont attractives, en particulier pour l'industrie pharmaceutique, avec une demande importante en santé publique et vétérinaire. Ce projet à fort potentiel de valorisation a été monté avec l'intention de protéger les variants d'AvBD2 et d'AvBD7 obtenus grâce au dépôt d'une demande de brevet. Un point positif important atteint avec ce projet est la construction du gène de l’AvBD7 dans Yarrowia lipolytica comprenant la séquence d’adressage complète pré-pro-Lip2 native (SSLP) qui permet de produire plus efficacement la défensine. De plus, une méthode développée par le partenaire 1 a permis d’évaluer la quantité produite. Cette quantité a été améliorée par le partenaire 2 en jouant sur la surexpression d’une protéine chaperonne (PDI) de Yarrowia, sur la composition de son milieu de culture, et sur les conditions de fermentation et d’induction du promoteur au cours du "feedbatch". Néanmoins, le milieu synthétique de la culture industrielle consécutive a rendu difficile la quantification de la production de défensines par ELISA. Ces résultats soulignent la difficulté d’obtention de ces molécules à des concentrations permettant la mesure de l’activité biologique. Ils montrent aussi que nous avons réussi à: (i) faire produire chaque défensine par Yarrowia lipolytica en optimisant le promoteur et la séquence signal de la construction génique, ce qui n’avait jamais été fait auparavant; (ii) multiplier par dix le niveau de production en ajoutant la protéine chaperonne de Yl et en augmentant l’échelle de production; (iii) identifier des acides aminés potentiellement cibles de mutations visant à augmenter l’activité antimicrobienne. Finalement, même si les deux défensines aviaires ont pu être produites en fermenteurs à des concentrations non exploitables (environ 3mg/L), il est fort probable que leur production chez l’hôte naturel par les cellules hétérophiles doit se faire dans des conditions particulièrement difficiles à transposer en système levure et à l’échelle industrielle. Il reste toutefois imaginable que la production de ces molécules à activité antimicrobienne puisse être amplifiée in vivo pour faire barrière aux infections en jouant sur la stimulation de l’animal hôte par voie alimentaire ou par voie de vaccination.
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Dates et versions

hal-04188500 , version 1 (25-08-2023)

Licence

Paternité - Pas d'utilisation commerciale - Pas de modification

Identifiants

  • HAL Id : hal-04188500 , version 1

Citer

Anne-Christine Lalmanach, Jean-Marc Nicaud, Gwenaëlle André-Leroux. Compte-rendu scientifique final du projet pre-maturation INRA 2018-2020 PROVIDEFENSE Titre du projet : Production de défensines aviaires recombinantes pour la santé animale. INRAE. 2020, 7 p. ⟨hal-04188500⟩
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