Technique d’extraction d’ADN génomique de végétaux permettant l’amplification de longs fragments à partir d’une petite quantité de matériel - INRAE - Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement
Article Dans Une Revue Cahier des Techniques de l'INRA Année : 2018

Technique d’extraction d’ADN génomique de végétaux permettant l’amplification de longs fragments à partir d’une petite quantité de matériel

Résumé

The extraction of genomic DNA from a small quantity of vegetal material is commonly made/practiced by means of commercial kits, which have the advantages to be rapid, reproductible and toxic solvent-free. These commercial kits are effective when the obtained samples are used to amplify by PCR (polymerase chain reaction) small fragments (<1 kb). As we have to amplify by PCR a large fragment of DNA (> 3kpb), we set up a protocol described in this paper that allows us to extract from small strands of vegetal material a DNA of high molecular weight. Our results show that the expected PCR amplification can be made on our samples and that their shelf-life lasts long. We also show that this protocol can be applied on other vegetal species. Moreover, the cost per sample is reduced in comparison with an extraction made with a laboratory supplier kit.
L’extraction d’ADN génomique à partir d’une faible quantité de matériel végétal est couramment réalisée à l’aide de kits commerciaux qui ont pour avantage la rapidité, la reproductivité et l’absence d’utilisation de solvants toxiques. Ces kits sont efficaces lorsque les échantillons obtenus sont destinés à des amplifications par PCR de fragments de petite taille. Étant dans l’obligation d’amplifier par PCR (polymerase chain reaction) un fragment d’ADN de grande taille (>3kpb), nous avons mis au point le protocole décrit dans cet article qui nous permet d’extraire sur de petites quantités de matériel végétal de l’ADN de haut poids moléculaire. Nos résultats montrent que l’amplification PCR attendue peut être réalisée sur nos échantillons, et que ces derniers se conservent bien dans le temps. Nous montrons aussi que ce protocole peut être appliqué à d’autres espèces végétales. De plus, le coût par échantillon est réduit par rapport à une extraction réalisée avec un kit d’un fournisseur de laboratoire.
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hal-02628282 , version 1 (26-05-2020)

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  • PRODINRA : 456352

Citer

Stephane Benedit, Pierre Barret. Technique d’extraction d’ADN génomique de végétaux permettant l’amplification de longs fragments à partir d’une petite quantité de matériel. Cahier des Techniques de l'INRA, 2018, 95, 10 p. ⟨hal-02628282⟩
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