Animal Phenotyping for the Agroecological Transition of Livestock Systems
PATASEL Phénotypage Animal pour la Transition Agroécologique des Systèmes d'ELevage
Résumé
The PATASEL project (Animal Phenotyping for the Agroecological Transition of Livestock Systems) is supported by the LiPH4SAS research infrastructure (www.liph4sas.fr). LIPH4SAS is a distributed RI , which can also take advantage of diversified genetic resources, environments and farming systems (Normandy hedgerow vs. mid-mountains, conventional vs. organic systems). It enables both multi-scale functional exploration and measurements, at animal level, on large batches of animals (horizontal phenotyping) with controlled health status and located in controlled and characterised environments. The first objective of the PATASEL project is to equip LIPH4SAS with state-of-the-art animal phenotyping equipment. Most of the equipment planned as part of the project was acquired by 2024, enabling the associated research projects to run successfully (in particular the WAIT4, HOLOBIONTS, COBREEDING and AGRODIV projects). In particular, they concern the measurement of key characteristics for the agro-ecological transition and adaptation to climate change (intake of concentrated feed, forage and water, greenhouse gases, behaviour, welfare and health indicators, environmental parameters). The second objective of PATASEL is to ensure the FAIRisation of the data produced, its interoperability with data produced from other infrastructures (RARe, France Génomique) and its availability to the scientific communities. A first version of SPIDER, a platform providing access to all the data collected on each animal, is currently being tested.
Le projet PATASEL (Phénotypage Animal pour la Transition Agroécologique des Systèmes d’Elevage) est porté par l'infrastructure de recherche (IR) LiPH4SAS (www.liph4sas.fr). LIPH4SAS est une IR distribuée, qui permet également de tirer parti de ressources génétiques, d’environnements et de systèmes d’élevage diversifiés (bocage normand vs moyenne montagne, système conventionnel vs bio). Elle permet à la fois une exploration fonctionnelle multi- échelle et des mesures, à l'échelle de l'animal, sur de grands lots d'animaux (phénotypage horizontal) au statut sanitaire contrôlé et situés dans des environnements maîtrisés et caractérisés. Le premier objectif du projet PATASEL est de doter LIPH4SAS d’équipements de phénotypage animal performants. L’essentiel des équipements prévus dans le cadre du projet a été acquis dès 2024, permettant le bon déroulement des projets de recherche associés (projets WAIT4, HOLOBIONTS, COBREEDING, AGRODIV notamment). Ils concernent notamment la mesure caractères clés pour la transition agroécologique et l’adaptation au changement climatique (ingestion d’aliments concentrés, de fourrages et d’eau, gaz à effets de serre, comportements , indicateurs de bien-être et santé, paramètres d’environnement). Le second objectif de PATASEL est d’assurer la FAIRisation des données produites, leur interopérabilité avec les données produites via d’autres infrastructures (RARe, France Génomique) et leur mise à disposition des communautés scientifiques. Une première version de SPIDER, plateforme permettant l’accès à l’ensemble des données collectées sur chaque animal, est actuellement en cours de test..
Domaines
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